，从化学结构来看，PFA是由四氟乙烯、全氟烷基乙烯基醚共聚而成，而PTFE则是由四氟乙烯均聚得到。这种细微结构差异导致了它们不同物理特性。PFA具有更高熔融流动性，这使得它更容易加工成型，适合用于生产复杂形状零件。相比之下，PTFE因为其分子链高度规整性、结晶度，表现出极高耐化学性、低摩擦系数，但它较难加工，通常要预成型后烧结。
于使用温度方面，PFA工作温度范围为200°C至+260°C，而PTFE则可达200°C至+250°C。虽然两者都能承受极端低温，但于高温下PFA显现出更好机械强度保持率，这对于某些工业用途来说至关很大。
另外，PFA以其优秀透明度著称，这对那些对外观有要求用途场合非常有利；而PTFE通常是不透明。于电气不导电性能上，两者都非常突出，但PFA因为更好加工性，于一些精密元件中更受欢迎。
上述概括起来选择PFA还是PTFE取决于具体用途需求。如果要优良加工性能、高透明度，则PFA是更好选择；若追求极致耐化学性、低摩擦系数，则PTFE也许是更合适选择。
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