DAPI的荧光特性使其在蓝光激发下（通常为358纳米或405纳米）发出强烈的紫红色荧光（约461纳米）。它能非特异性地结合到双链DNA上，通过插入到A-T碱基对之间的大沟中，形成稳定的复合物，从而被激发产生荧光。由于其对DNA的高度亲和力和几乎无毒性，DAPI成为一种方便且高效的细胞核染色工具。
值得注意的是，DAPI不仅仅可以用于固定细胞的染色，也可以用于活细胞染色，但因为其能穿透细胞膜并可能对细胞造成一定的影响，所以在活细胞实验中使用时需要谨慎。此外，DAPI还可以用于检测凋亡细胞，因为凋亡细胞的DNA会碎片化，这会增加DAPI的染色强度。
总的来说，DAPI作为一种强大的荧光探针，对于理解细胞的结构、功能以及生命过程中的各种变化具有重要的作用。
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