，于化学结构上，PTFE是由单一四氟乙烯单体聚合而成，而FEP则是由四氟乙烯、六氟丙烯两种单体共聚得到。这种不同结构导致了它们于热稳固性上区别。PTFE具有极高耐热性，可于260℃下一直使用，并且于短时间内能承受高达300℃温度，表现出优秀热稳固性。相比之下，FEP熔融温度较低，通常于250260℃之间，这使得它更适合于要熔融加工用途场景。
从机械性能来看，FEP比PTFE更柔软、更具弹性，因此于某些要优良柔韧性场合中表现更为突出。另外，FEP介电性能优于PTFE，尤其是于高频条件下，其介电常数、损耗因子都较小，这对工业中高频电缆不导电材料选择非常很大。
于加工方式上，两者也有很大不同。PTFE因为分子链刚性、结晶度较高，难以通过传统热塑性塑料方法进行加工，通常采用烧结成型特殊工艺；而FEP则可以像普通热塑性塑料一样被挤出或注塑成型，从而大大简化了生产流程并降低了成本。
尽管如此，PTFE仍然以其超强化学惰性、低摩擦系数著称，于防腐蚀设备、密封件行业占据主导位。而FEP凭借其特殊加工特性、优良综合性能，于电线电缆护套、涂层还有微波通信方面得到了大量用途。这两种材料各自拥有特殊优势，于不同行业发挥着不可替代作用。
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