，从化学结构来看，FEP是一种由四氟乙烯、六氟丙烯共聚而成线型高分子材料，而PTFE则是由四氟乙烯均聚得到交联结构。这种结构上差异导致了两者于热稳固性、加工性能上不同。PTFE因为其高度交联结构，具有极高耐温性、化学稳固性，可于200℃至260℃范围内一直使用，并且几乎不被任何化学物质侵蚀。然而，这种特性也使得PTFE难以加工成型，通常要通过冷压烧结复杂工艺来生产成品。
相比之下，FEP虽然同样含优良耐腐蚀性、较低摩擦系数，但它线型结构使其拥有更佳可加工性。FEP可以于200℃以下通过挤出或注塑方式成型，这大大拓宽了其用途场景，尤其是于要复杂形状零件场合中表现突出。另外，FEP还具有更好透明度、电不导电性能，适合用于制作电线电缆护套还有光学器件。
于实际用途中，这两种材料各有千秋。例如，于半导体工业中，因为对纯度要求极高，PTFE被选作反应容器内衬；而对于一些精密仪器中密封圈，则也许优先考虑FEP以满足特定设计需求。选择哪一种材料取决于具体工况条件、个人偏好。
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